本病只有手術治療，一般需分次手術，分別矯正瞼裂短小、內眥間距過寬和上瞼下垂。

　　1、輕度瞼裂短小：內眥成形，內眥贅皮矯正。

　　2、瞼裂過于短小：內眥成形聯合外眥開大成形。

　　3、上瞼下垂矯正：一般先天性小瞼裂綜合征都是重度上瞼下垂，所以通常利用額肌懸吊術矯正上瞼下垂。

　　手術時機：一方面要考慮提上瞼肌自身發育，一方面要防止形成弱視，因此手術宜選擇在3~5歲以后、學齡前進行。分次手術者兩次手術間隔應在半年以上。

　　手術適應癥：參照上瞼下垂手術適應癥，如合并眼球上轉肌麻痹，患兒閉目時眼球不能上轉（Bell現象不存在）時，術后易發生暴露性角膜炎，手術應特別慎重。另外由于內、外眥開大術皮膚瘢痕較多，已知為瘢痕體質者選擇手術要慎重。